Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
NdnP25233 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms