Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Znf239P24399 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Znf239P24399 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf239P24399 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf239P24399 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf239P24399 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf239P24399 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf239P24399 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf239P24399 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf239P24399 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Znf239P24399 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Znf239P24399 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf239P24399 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Znf239P24399 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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