Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RarbP22605 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RarbP22605 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RarbP22605 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RarbP22605 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms