Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
P18530 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P18530 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
P18530 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
P18530 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
P18530 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
P18530 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P18530 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms