Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18528 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18528 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18528 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms