Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrphP15331 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrphP15331 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PrphP15331 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PrphP15331 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PrphP15331 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms