Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp54P14576 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Srp54P14576 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms