Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb1P13372 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Vpreb1P13372 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms