Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Defa1P11477 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms