Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp1P11438 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp1P11438 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms