Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prf1P10820 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms