Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms