Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TtrP07309 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TtrP07309 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TtrP07309 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TtrP07309 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TtrP07309 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TtrP07309 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TtrP07309 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
TtrP07309 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
TtrP07309 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TtrP07309 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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