Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxa4P06798 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxa4P06798 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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