Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
P01757 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
P01757 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01757 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01757 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01757 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms