Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01648 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01648 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01648 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01648 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01648 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01648 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01648 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01648 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01648 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01648 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01648 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01648 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01648 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01648 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01648 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01648 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01648 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01648 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms