Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casp8O89110 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casp8O89110 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casp8O89110 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms