Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CopeO89079 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CopeO89079 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CopeO89079 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms