Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hcn2O88703 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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