Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ClppO88696 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClppO88696 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClppO88696 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ClppO88696 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClppO88696 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ClppO88696 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ClppO88696 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ClppO88696 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ClppO88696 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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