Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
AurkcO88445 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AurkcO88445 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AurkcO88445 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms