Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AvilO88398 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AvilO88398 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms