Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx7O70439 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx7O70439 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx7O70439 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx7O70439 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx7O70439 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx7O70439 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx7O70439 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx7O70439 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx7O70439 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx7O70439 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx7O70439 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms