Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nptx2O70340 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms