Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lnx1O70263 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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