Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ldb2O55203 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ldb2O55203 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ldb2O55203 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ldb2O55203 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb2O55203 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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