Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dsg2O55111 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms