Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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BckdkO55028 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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BckdkO55028 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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BckdkO55028 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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BckdkO55028 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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BckdkO55028 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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BckdkO55028 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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BckdkO55028 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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BckdkO55028 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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BckdkO55028 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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BckdkO55028 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
BckdkO55028 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
BckdkO55028 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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