Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn5O54942 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn5O54942 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms