Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc4O35988 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdc4O35988 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Sdc4O35988 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Sdc4O35988 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdc4O35988 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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