Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp100O35892 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sp100O35892 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sp100O35892 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sp100O35892 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sp100O35892 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Sp100O35892 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sp100O35892 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sp100O35892 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sp100O35892 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sp100O35892 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp100O35892 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sp100O35892 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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