Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cited2O35740 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cited2O35740 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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