Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klf12O35738 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf12O35738 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms