Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ppfibp2O35711 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms