Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clk2O35491 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clk2O35491 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clk2O35491 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms