Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RrhO35214 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RrhO35214 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms