Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Scarb2O35114 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Scarb2O35114 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms