Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn4O35054 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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