Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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H2-Q1O19441 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
H2-Q1O19441 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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H2-Q1O19441 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-Q1O19441 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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H2-Q1O19441 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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H2-Q1O19441 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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H2-Q1O19441 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
H2-Q1O19441 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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H2-Q1O19441 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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H2-Q1O19441 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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H2-Q1O19441 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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H2-Q1O19441 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-Q1O19441 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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H2-Q1O19441 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-Q1O19441 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-Q1O19441 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-Q1O19441 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-Q1O19441 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-Q1O19441 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
H2-Q1O19441 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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H2-Q1O19441 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
H2-Q1O19441 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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