Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra2O08842 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra2O08842 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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