Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Efna3O08545 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Efna3O08545 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Efna3O08545 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Efna3O08545 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Efna3O08545 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Efna3O08545 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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