Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Efna5O08543 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efna5O08543 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.9 ms