Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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