Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fam240aJ3QNP9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms