Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gm17577J3QNF7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms