Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm21972J3QN38 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21972J3QN38 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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