Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Gm20918J3QN17 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm20918J3QN17 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm20918J3QN17 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm20918J3QN17 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Gm20918J3QN17 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Gm20918J3QN17 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20918J3QN17 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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