Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3415J3QMS8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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