Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms