Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm20830J3KML6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms